牲畜粪便等有机物在发酵过程中常常需要加入秸秆粉末等物料，并且对物料的颗粒度有一定的要求，所以需要一些粉碎设备。常用的粉碎设备主要有打散机、切草机、锤片粉碎机、木材粉碎机等。一般的待粉碎物料的含水率都较低，而大部分有机原料却是含水率较高和易结团的物料，如各种废渣、部分禽畜粪便以及各种结团的污泥类等。而发酵时物料的粒度不能太细，因此对这些物料只能采用打散机处理。
基于以上原因，要求打散机需具有相对转速低、无筛、防黏结、易清理的特点。对于干的长纤维类的物料，如秸秆等，可以采用常用的秸秆粉碎机粉碎。粉碎时可调大筛孔，无需粉碎得过细，以满足发酵粒度要求即可；也可采用一般的切草机将其切断成约寸长的碎片发酵。对于粮食加工后的废弃物，如稻壳、玉米棒、饼粕类等物料，因其含水率较低，可采用一般的锤片粉碎机就能达到满意的效果。对于新鲜木质类，如园林修剪后树枝、花草等，则需采用专用的树枝粉碎机；干木质类则可采用木材粉碎机。
对于粪便型、糟渣类和纤维较多、黏性小的发酵物，可采用具有强力打碎、搅拌作用的有机肥翻堆机，这样可以省却原料搅拌打碎这些前处理工序，减少了生产环节。同时，每一次的翻堆都是对物料进行一次打碎和搅拌，提高了物料的发酵速度，也使有机物料更均匀、疏松。槽式有机肥翻堆机因其在固定轨道上行走，大多采用电机驱动，其价格主要与其电机功率有关。
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